Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
WhammQ571B6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
WhammQ571B6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
WhammQ571B6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms