Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spire1Q52KF3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spire1Q52KF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms