Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox3aQ4TU90 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhox3aQ4TU90 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms