Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc3lQ4KL14 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trappc3lQ4KL14 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms