Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ddx49Q4FZF3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms