Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ckap2Q3V1H1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ckap2Q3V1H1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms