Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms