Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Dnah12Q3V0Q1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnah12Q3V0Q1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms