Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Garnl3Q3V0G7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Garnl3Q3V0G7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms