Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Usp48Q3V0C5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms