Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hipk4Q3V016 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 488.8 ms