Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed1Q3V009 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms