Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E330034G19RikQ3UWX6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms