Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B230104I21RikQ3USW4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms