Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm28047Q3US59 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm28047Q3US59 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms