Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Znf48Q3US17 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Znf48Q3US17 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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