Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Nhlrc4Q3UP44 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Nhlrc4Q3UP44 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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