Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Nlrc4Q3UP24 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nlrc4Q3UP24 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms