Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem253Q3UNB8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms