Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrxosQ3UL53 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrxosQ3UL53 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms