Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sf3b2Q3UJB0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms