Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dtx3lQ3UIR3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms