Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Puf60Q3UEB3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms