Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Parp8Q3UD82 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms