Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssbp4Q3U4B1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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