Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sec24aQ3U2P1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sec24aQ3U2P1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms