Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Kdm4dQ3U2K5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Kdm4dQ3U2K5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms