Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Rnf149Q3U2C5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf149Q3U2C5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf149Q3U2C5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rnf149Q3U2C5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rnf149Q3U2C5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf149Q3U2C5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf149Q3U2C5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rnf149Q3U2C5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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