Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Serac1Q3U213 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Serac1Q3U213 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms