Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Lrrc28Q3TX51 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrc28Q3TX51 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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