Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TchpQ3TVW5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TchpQ3TVW5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms