Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Ccndbp1Q3TVC7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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