Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdnep1Q3TP92 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctdnep1Q3TP92 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms