Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc10Q3TLI0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms