Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Smarca4Q3TKT4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Smarca4Q3TKT4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms