Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms