Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nlrp1aQ2LKU9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms