Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpne9Q1RLL3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne9Q1RLL3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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