Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrriq3Q14DL3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms