Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam171bQ14CH0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms