Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd9Q14BI7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd9Q14BI7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms