Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fam47cQ14BE7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms