Protein–RNA interactions for Protein: Q148W8

Dusp27, Inactive dual specificity phosphatase 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp27Q148W8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Dusp27Q148W8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp27Q148W8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Dusp27Q148W8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Dusp27Q148W8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Dusp27Q148W8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Dusp27Q148W8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Dusp27Q148W8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Dusp27Q148W8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Dusp27Q148W8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dusp27Q148W8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms