Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
VgfQ0VGU4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VgfQ0VGU4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms