Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gli2Q0VGT2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gli2Q0VGT2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms