Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc45a4Q0P5V9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms