Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spata18Q0P557 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Spata18Q0P557 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms