Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrioQ0KL02 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrioQ0KL02 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms