Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Kndc1Q0KK55 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Kndc1Q0KK55 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms