Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pate4Q09098 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms